Născut la 6 februarie 2001, la Podujeve (Kosovo), Hyseni a evoluat în ultimul sezon în țara natală, pentru KF Llapi, pentru care în 32 de partide a marcat 12 goluri și a oferit 3 pase decisive.
În sezonul 2023/2024 a fost golgheterul campionatului din Kosovo cu 26 de goluri și 7 pase decisive în 36 de meciuri.
În carieră a evoluat în 108 partide în prima ligă din Kosovo, în care a reușit 41 de goluri și 13 pase decisive.
Muhamet Hyseni are și 2 selecții pentru naționala din Kosovo, pentru care a reușit 1 gol.
A mai evoluat în țara natală pentru Feronikeli 74 și FC Malisheva, dar și în Danemarca, pentru AC Horsens.
